В 1922 году в г. Вятке был организован ветеринарный техникум со сроком обучения 4 года.
В 1925 г. состоялся первый выпуск ветфельдшеров.
В 1937 г. произошло слияние ветеринарного факультета Вологодского сельскохозяйственного института с Кировским (Вятка) зооветеринарным институтом. В освободившиеся аудитории ветеринарного факультета Вологодского сельхозинститута из г. Кировска, по решению Министерства совхозов СССР, был переведен в г. Вологду ветеринарный техникум.
В то время техникум располагал 10 учебными кабинетами, анатомическим музеем, ветеринарной клиникой. Отделения учебной ветеринарной клиники: хирургическое, терапевтическое, акушерское – были хорошо обеспечены оборудованием и инструментарием, имели учебные манежи. При ветклинике был операционный манеж, имелся хорошо оборудованный физиотерапевтический кабинет, аптека и лаборатория. За предвоенные годы (1922–1940) Вологодский ветеринарный техникум выпустил 1117 ветеринарных фельдшеров для нужд сельскохозяйственного производства.
За годы Великой Отечественной войны (1941 –1945) техникум подготовил и выпустил 254 ветфельдшера. С первых дней войны на защиту Отечества ушли лучшие преподаватели специальных дисциплин: С. М. Ванеев, П. Н. Крашенинников, С. В. Мухин, С. В. Христолюбов и другие. Ушли на защиту Отечества и многие учащиеся техникума.
За послевоенные годы Вологодский ветеринарный техникум продолжал укреплять и совершенствовать свою материально-техническую базу и подготавливать специалистов для хозяйств области и страны. Так, начиная с 1946 г. и по 1960 г. было подготовлено 1255 ветеринарных фельдшеров. Вологодский ветеринарный техникум был неоднократно участником ВСХВ в г. Москве в 1954, 1955, 1956 гг., передавая свой опыт другим сельскохозяйственным учебным заведениям.
В 1959–1960 учебном году было открыто новое зооветеринарное отделение, которое существовало до 1968 года и за этот период подготовило 88 зооветспециалистов.
В 1956 году начато строительство нового учебного корпуса по ул. Горького на 480 человек. Учащиеся техникума отработали на строительстве корпуса техникума 5220 чел./дней. Новый учебный корпус ветеринарного техникума был пущен в эксплуатацию в 1960 году. Ряд преподавателей ветеринарных дисциплин (П. Н. Крашенинников, Г. В. Тихонов, А. Н. Терезова) являлись авторами и соавторами учебников и учебных пособий для ветеринарных техникумов страны.
На основании приказа Минсельхозпрода РСФСР и в связи с ликвидацией бухгалтерского отделения в В-Устюгском сельхозтехникуме в 1962 г., в Вологодском ветеринарном техникуме было открыто отделение по специальности «Планирование и учет» с очной и заочной формой обучения. В связи с открытием бухгалтерского отделения, приказом Минсельхоза РСФСР № 66 от 11.05.1968 г. Вологодский ветеринарный техникум был реорганизован в Вологодский сельскохозяйственный техникум.
В 1965 г. состоялся первый выпуск бухгалтеров-плановиков в количестве 77 человек.
В 1994 году к сельскохозяйственному техникуму был присоединён аграрный техникум.
В 2010 году Вологодский сельскохозяйственный техникум получил статус аграрно-экономического колледжа.